De veerboot van Athene naar Santorini vaart dagelijks van Piraeus naar de haven van Athinios, doet er 4 uur 50 min tot 11 uur 30 min over en heeft tickets vanaf €45,50. In de zomer zijn er tot 6 à 8 afvaarten per dag met Seajets (het snelst), Blue Star en Fast Ferries.
Dit is de klassieke manier om de Cycladen binnen te varen: 's ochtends aan boord in de grote haven van Athene en dezelfde middag of avond aankomen onder de calderakliffen van Santorini. De overtocht beslaat ongeveer 127 zeemijl, en de conventionele schepen doen onderweg meestal andere eilanden aan, zodat je in slow motion door de Egeïsche Zee trekt voordat de rand van de vulkaan opdoemt. Over zee aankomen, met de witte dorpen Fira en Oia hoog boven je op de kliffen, is iets wat een vlucht gewoonweg niet kan evenaren.
Santorini is het drukste eiland van de groep, dus een beetje planning loont. Athinios, waar alle veerboten aanleggen, ligt aan de voet van de calderawand, en de zigzagweg naar Fira staat vaak vast als er twee schepen tegelijk aankomen. Boek je transfer of weet welke bus je neemt voordat je aankomt. Veel bezoekers blijven hier drie of vier nachten en varen daarna door naar Ios, Naxos, Paros of Kreta in plaats van direct terug naar Athene.
De grote vraag is welke boot. Seajets is duidelijk duurder dan Blue Star, maar kan je een aantal uren schelen. Blue Star Ferries biedt voor de meeste mensen de beste prijs-kwaliteitverhouding en neemt auto's mee, terwijl Fast Ferries de traagste optie is, met lange routes langs meerdere eilanden op een paar dagen per week. Boek in juli en augustus vroeg: de snelle boten en de goedkoopste stoelen gaan het eerst.