Il traghetto da Santorini a Naxos parte ogni giorno tutto l'anno, con diverse partenze al giorno d'estate (7 nel nostro campione del 12 agosto 2026). La traversata dura da 1 h 10 min a 2 h 35 min, con biglietti da 31 €.
Dopo il dramma vulcanico di Santorini, Naxos offre un contrasto totale: lunghe spiagge dorate, verdi valli di montagna, villaggi vivi e alcuni dei migliori prodotti locali delle Cicladi. Le due isole distano circa 43 miglia nautiche e il traghetto sale verso nord passando per Ios, quindi è uno dei salti più naturali di qualsiasi itinerario tra le isole. Molti atterrano a Santorini, passano qualche notte sulla caldera, poi si spostano a Naxos per godersi il mare con un ritmo e prezzi più morbidi.
I due porti non potrebbero essere più diversi. Athinios, a Santorini, è un porto angusto ai piedi di una scogliera, raggiungibile con una strada a tornanti che si intasa quando arrivano le navi. La Chora di Naxos, invece, è una vera città portuale: scendi dalla nave su un lungomare pieno di caffè, con la Portara da un lato e l'antico Kastro sopra.
La scelta pratica è tra Blue Star Ferries, più economica a circa 31,50 €, che impiega circa 2 ore e imbarca auto, e i catamarani Seajets, più veloci ma che costano circa il doppio. Organizza prima del giorno di partenza il passaggio fino ad Athinios, perché d'estate taxi e autobus si riempiono, e calcola molto tempo per la strada del porto.