O ferry de Atenas para Santorini parte diariamente do Pireu com destino ao porto de Athinios, demora de 4 h 50 min a 11 h 30 min e tem bilhetes a partir de 45,50 €. No verão há até 6 a 8 partidas por dia com a Seajets (a mais rápida), a Blue Star e a Fast Ferries.
Esta é a forma clássica de entrar nas Cíclades: embarcar de manhã no grande porto de Atenas e chegar sob as falésias da caldeira de Santorini nessa mesma tarde ou noite. A travessia cobre cerca de 127 milhas náuticas e os navios convencionais costumam fazer escala noutras ilhas pelo caminho, pelo que faz uma volta ao Egeu em câmara lenta antes de surgir a borda do vulcão. Chegar por mar, com as aldeias brancas de Fira e Oia empoleiradas no alto das falésias, é algo que um voo simplesmente não consegue igualar.
Santorini é a ilha mais movimentada do grupo, por isso compensa planear. Athinios, onde atracam todos os ferries, fica no sopé da parede da caldeira, e a estrada em ziguezague até Fira está muitas vezes congestionada quando chegam dois navios ao mesmo tempo. Reserve o transfer ou saiba qual é o seu plano de autocarro antes de desembarcar. Muitos visitantes passam aqui três ou quatro noites e depois seguem de ferry para Ios, Naxos, Paros ou Creta, em vez de voltarem diretamente a Atenas.
A grande decisão é o barco. A Seajets é bastante mais cara do que a Blue Star, mas pode poupar várias horas. A Blue Star Ferries tem a melhor relação qualidade-preço para a maioria das pessoas e transporta carros, enquanto a Fast Ferries é a opção mais lenta, com longos itinerários por várias ilhas alguns dias por semana. Em julho e agosto, reserve cedo: os barcos rápidos e os lugares mais baratos são os primeiros a esgotar.