Os ferries entre Ios e Santorini funcionam todo o ano, seis a sete dias por semana. A viagem demora entre 30 minutos e 1 h 20 min, consoante o tipo de ferry. Os bilhetes começam em apenas 6,50 €. A rota é servida pela Seajets, Blue Star Ferries, Golden Star Ferries, Fast Ferries e Maistros Santorini.
Para a maioria das pessoas, esta é a última etapa de uma viagem para sul pelas Cíclades, ou o primeiro passo para fora de Santorini em direção a um sítio mais calmo. As duas ilhas estão tão perto que se veem as falésias de Santorini a erguerem-se à frente pouco depois de sair de Ios, mas parecem mundos à parte: Ios é praias, uma Chora compacta e um público jovem e descontraído, enquanto Santorini é a famosa caldeira, as aldeias no alto das falésias e os miradouros do pôr do sol.
Parte-se do pequeno porto de Ios, na costa oeste, logo abaixo da Chora, e chega-se a Athinios, o principal porto de ferries de Santorini, encaixado sob a parede da caldeira. Athinios é mais funcional do que bonito, e o verdadeiro trabalho começa depois de desembarcar: subir a estrada em ziguezague até Fira, Oia ou ao seu hotel. Tratar desse transfer é tão importante como escolher o barco.
A diferença de preço entre barcos é grande. Os ferries convencionais são baratos e demoram cerca de uma hora ou pouco mais, enquanto os lugares rápidos da Seajets e da Golden Star Ferries custam muitas vezes mais por uma travessia que muitas vezes é apenas 20 a 30 minutos mais curta. Num dia de pico no verão há partidas desde muito cedo até à noite, por isso normalmente consegue ajustar o barco ao check-in do hotel.